La plateforme Imagerie Cytométrie (ImCy)

La plateforme d’Imagerie-Cytométrie de Généthon (ImCy) est, avec plus de 15 ans d’expérience dans l’accompagnement des chercheurs en thérapie génique, non seulement experte dans l’acquisition de données de cytométrie et d’images de microscopie mais également dans l’analyse profonde et quantitative de ces données et images.

Présentation

La présence au sein du même département des experts de cytométrie et d’imagerie permet un enrichissement mutuel entre les experts de ces deux domaines.

Nous possédons un parc riche en instruments et nous proposons nos services aux équipes de recherche de Généthon, et également sous un format collaboratif ou de prestation, aux équipes de l’Institut des Biothérapies de l’AFM-Téléthon ainsi qu’aux acteurs privés ou publics du biocluster Genopole (Evry-Courcouronnes), ou des acteurs nationaux et internationaux intéressés par notre expertise reconnue.

Pour toute demande, contacter la plateforme Imagerie.

Les membres de la plateforme Imagerie

Daniel STOCKHOLM

PhD, Responsable de la plateforme, maître de conférences EPHE

Spécialités : imagerie cellulaire, traitement d’images, intelligence artificielle, transcriptomique, analyse de données

Peggy SANATINE

Ingénieure, experte en cytométrie

Spécialités : cytométrie conventionnelle et spectrale, tri cellulaire, analyse de données de cytométrie, relais auprès du service Qualité

Jérémie COSETTE

PhD, Ingénieur de recherche en imagerie

Spécialités : imagerie, traitement d’images, instrumentation, cytométrie en images


Les activités

La plateforme d’Imagerie-Cytométrie de Généthon (ImCy) possède des activités variées majoritairement basées sur l’acquisition de données et leur analyse.

Nous proposons l’acquisition d’images, avec différents degrés de définition et de résolution, sur nos différents équipements, en autonomie et de manière assistée, ainsi que leur analyse par différentes solutions commerciales ou développés par nos soins. Nous proposons l’acquisition de données de cytométrie, le tri cellulaire et l’analyse de ces données avec différents logiciels adaptés aux appareils et aux besoins de nos clients.

Nous mettons également à disposition de nos partenaires :

  • Notre expertise conseil pour la préparation ou le design d’un projet ou d’une expérience ;
  • Notre expertise en modélisation numérique ;
  • Notre expertise transdisciplinaire pour créer des liens collaboratifs avec d’autres plateformes ou équipes de recherche (microscopie à force atomique, méthodes d’analyse biophysiques, RMN…).

Notre expérience dans le domaine de l’imagerie, de la cytométrie, des maladies génétiques et des biothérapies fait de notre plateforme un acteur francilien reconnu notamment dans l’analyse de l’efficacité des thérapies géniques appliquées aux cellules musculaires.

Au-delà de notre politique de jouvence, proposant ainsi des technologies les plus à la pointe possible, notre plateforme est un acteur national de l’imagerie et de la cytométrie appliqués à la quantification des effets des thérapies sur les maladies rares et particulièrement neuromusculaires, renforçant et échangeant notre savoir-faire à travers de nombreuses collaborations.

Les équipements

Nous possédons un parc d’équipements permettant, grâce à la complémentarité de l’imagerie et de la cytométrie, l’analyse d’échantillons biologiques à différentes échelles. Cela dans le but d’accompagner des études intégratives et multimodales depuis l’analyse du petit animal entier par bioluminescence jusqu’à la localisation de protéines en super résolution (STED) en passant par le phénotypage de populations cellulaires par cytométrie.

Associés à nos appareils, nous possédons des postes d’analyses indépendants, dont certains sont munis de logiciels spécifiques à certaines analyses (Imaris, etc.).

CYTOMETRIE
DénominationFournisseurDescription
MoFlo ASTRIOS EQBeckman-CoulterTrieur-cloneur de cellules à haute vitesse
4 Lasers 14 Param. Fluo. + Morpho
CytoFLEX LXBeckman-CoulterCytomètre en flux avec passeur de plaques
4 Lasers 17 Param. Fluo. + Morpho
CytoFLEX SBeckman-CoulterCytomètre en flux avec passeur de plaques
4 Lasers 13 Param. Fluo. + Morpho
FC500Beckman-CoulterCytomètre en flux avec passeur automatique de tubes
2 Lasers 5 Param. Fluo.
SP6800SonyCytomètre en flux spectral
3 Lasers 32 PMTs
ISX MKIILuminexCytomètre en flux en images
3 Lasers 6 canaux
IMAGERIE
Imagerie du petit animal
DénominationFournisseurDescription
IVIS LuminaPerkin ElmerImagerie de bioluminescence petit animal
CELLVIZIOMauna KeaMicro-endoscope confocal fibré dédié au petit animal
Imagerie cellulaire
DénominationFournisseurDescription
Axioscan Z1ZeissScanner de lames (chargeur 100 lames)
Lampe LED 7 couleurs
Confocal TCS SP8LeicaMicroscope confocal avec scanner résonnant et module STED Gated 775nm
α3PhaseViewMicroscope à Feuille de lumière
4 lasers
Evos FLLife TechnologiesMicroscope à fluorescence inversé pour culture cellulaire
3 couleurs
Biostation IMNikonMicroscope Time-Lapse champ clair et fluorescence (2 canaux)
HoloMoniror M4PHI ImagingMicroscope holographique en time-lapse
AxioPlan FLZeissMicroscope droit à fluorescence + Caméra QImaging Retiga 2000R
Morphométrie BFNikonMicroscope droit champ clair pour cartographies
Morphométrie FLLeicaMicroscope droit à fluorescence pour cartographies
3 couleurs + polarisation
Ti Eclipse Inversé FLNikonMicroscope Inversé à fluorescence
3 couleurs + caméra monochrome
Hamamatsu Orca-spark

Le fonctionnement de la plateforme Imagerie

Notre fonctionnement est basé sur une relation clairement établie et transparente entre nos clients et nous-mêmes au travers de la signature d’une charte utilisateurs.

En effet chaque utilisateur de la plateforme d’Imagerie-Cytométrie de Généthon doit signer la charte utilisateur OCCIGEN qui fixe des critères d’engagement de la plateforme – informations sur la sécurité, mise à disposition d’appareils calibrés et étalonnés, réalisation des prestations et analyses dans un délai préalablement déterminé, apport de support technique, respect de la confidentialité, etc. – et des critères d’engagement du client – respect des consignes de sécurité et d’utilisation des appareils, information sur la nature des échantillons, règlement des prestations effectuées, mention de la plateforme dans toute communication, etc.

Nous proposons également des formations sur nos équipements afin de vous permettre, lorsque le projet le nécessite, d’utiliser notre plateforme en parfaite autonomie.

Pour toute demande d’accès aux équipements, de prestation, de formation, de renseignements, de grille tarifaire, vous pouvez nous contacter.

Membre du réseau